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中药学论文_基于网络药理学和分子对接技术探讨

来源:中国中药杂志 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-11-16
作者:网站采编
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摘要:文章摘要:目的 基于网络药理学和分子对接及技术探讨芪苈强心胶囊治疗慢性心力衰竭作用机制。方法 利用BAT-MANTCM平台检索芪苈强心胶囊的化学成分和靶点,通过GeneCards、OMIM、DisGeNE

文章摘要:目的 基于网络药理学和分子对接及技术探讨芪苈强心胶囊治疗慢性心力衰竭作用机制。方法 利用BAT-MANTCM平台检索芪苈强心胶囊的化学成分和靶点,通过GeneCards、OMIM、DisGeNET以及NCBI数据库获得慢性心力衰竭相关的靶点,利用PERL软件将中药和疾病的基因进行合并,得到交集基因,构建“中药-疾病”靶点数据库,利用Cytoscape3.7.2绘制“中药—疾病—有效成分—靶点”网络图,筛选出核心有效成分;利用STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络图,筛选出核心靶点,利用Bioconductor数据库和R版本4.0.4(64bit)软件对靶点进行基因本体(geneontology, GO)注释描述和京都基因与基因组百科全书(Kyotoencyclopediaofgenesandgenomics, KEGG)富集分析,并通过Autodock软件对核心有效成分以及靶点进行分子对接。结果 筛选出芪苈强心胶囊相关有效成分285个,非重复药物靶点772个;得到慢性心衰疾病靶点1982个,“中药-疾病”交集基因共238个,“中药-疾病-有效成分-靶点”网络图得到核心有效成分分别为韦德醇、人参皂甙-Rb2、十三烷酸、十五烷酸、十六烷酸、花生酸、月桂酸;PPI网络得到核心靶点为INS、ALB、AKT1、TNF、CREB1、TP53。GO富集分析预测出芪苈强心胶囊对慢性心衰治疗可能涉及肌肉系统过程、调节血液循环、血管直径的调节等过程;KEGG富集分析结果预测出芪苈强心胶囊治疗慢性心力衰竭可能与cGMP-PKG信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路相关。分子对接结果显示:结合能绝对值排名前2分别为韦德醇和ALB(-9.41 kcal/mol),以及韦德醇与TNF(-9.24 kcal/mol)。结论:本研究探讨了芪苈强心胶囊对慢性心衰的活性成分及其作用机制,证明芪苈强心胶囊可能通过韦德醇、人参皂甙-Rb2等有效成分作用于cGMP-PKG信号通路、钙信号通路等通路,进而调控INS、ALB等相关靶点,起到治疗慢性心衰的作用。

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项目基金:《中国中药杂志》 网址: http://www.zgzyzzzz.cn/qikandaodu/2021/1116/1775.html



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